Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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