Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VhlP40338 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VhlP40338 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VhlP40338 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VhlP40338 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VhlP40338 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VhlP40338 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VhlP40338 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VhlP40338 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VhlP40338 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
VhlP40338 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VhlP40338 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
VhlP40338 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms