Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpargP37238 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PpargP37238 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PpargP37238 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PpargP37238 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PpargP37238 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PpargP37238 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PpargP37238 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PpargP37238 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PpargP37238 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms