Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Apoc3P33622 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms