Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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