Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VtnP29788 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VtnP29788 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VtnP29788 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
VtnP29788 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VtnP29788 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VtnP29788 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VtnP29788 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
VtnP29788 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VtnP29788 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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