Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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