Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms