Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Pde6aP27664 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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