Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChgaP26339 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChgaP26339 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ChgaP26339 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChgaP26339 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChgaP26339 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChgaP26339 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChgaP26339 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChgaP26339 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChgaP26339 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChgaP26339 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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