Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms