Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RarbP22605 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RarbP22605 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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