Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SftpcP21841 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms