Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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