Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TP20293 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TP20293 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TP20293 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TP20293 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TP20293 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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TP20293 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TP20293 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms