Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P20040 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P20040 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms