Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CtsdP18242 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms