Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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PcnaP17918 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PcnaP17918 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PcnaP17918 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PcnaP17918 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PcnaP17918 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PcnaP17918 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PcnaP17918 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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PcnaP17918 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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PcnaP17918 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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PcnaP17918 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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