Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms