Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms