Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms