Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms