Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CtsbP10605 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms