Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P04212 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P04212 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P04212 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P04212 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P04212 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P04212 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P04212 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P04212 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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