Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3cP02301 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3cP02301 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H3f3cP02301 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms