Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01638 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01638 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01638 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01638 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01638 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01638 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01638 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01638 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01638 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01638 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01638 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01638 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01638 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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P01638 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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P01638 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01638 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01638 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01638 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01638 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01638 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01638 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01638 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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P01638 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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P01638 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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