Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Col5a1O88207 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col5a1O88207 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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