Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms