Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgceO70258 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgceO70258 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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