Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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