Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Foxd2O35392 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms