Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MttpO08601 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MttpO08601 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MttpO08601 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms