Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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