Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Efna3O08545 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms