Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3542K7N6U2 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms