Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms