Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms