Protein–RNA interactions for Protein: J3QMZ1

Gm21789, Predicted gene, 21789, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21789J3QMZ1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21789J3QMZ1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms