Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21060J3KMU4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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