Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms