Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms