Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms