Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
XntrpcF8VQM8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms