Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M1F7CXU4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-M1F7CXU4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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