Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms