Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10378F6XQQ1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm10378F6XQQ1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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