Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc1E9Q043 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms