Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc8E9PWG2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms