Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms