Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms